MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 plasmid1

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017471	TTGA	2	8	6	13	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017471	GAT	2	6	68	73	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017471	ATC	2	6	91	96	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017471	TTC	2	6	117	122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017471	CTAC	2	8	139	146	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017471	CTTT	2	8	311	318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017471	TCATG	2	10	392	401	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017471	GAT	2	6	429	434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017471	ATGA	2	8	447	454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017471	CAAA	2	8	478	485	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017471	TGC	2	6	502	507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017471	AAC	2	6	651	656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017471	TAAA	2	8	816	823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017471	A	6	6	829	834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017471	A	6	6	863	868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017471	AGTT	2	8	904	911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017471	ACC	2	6	957	962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017471	ATT	2	6	1027	1032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017471	TGAA	2	8	1040	1047	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017471	T	8	8	1075	1082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017471	ATT	2	6	1090	1095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017471	AC	3	6	1155	1160	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017471	CTA	3	9	1170	1178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017471	T	7	7	1181	1187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017471	CAAT	2	8	1240	1247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017471	TA	5	10	2125	2134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017471	TAT	2	6	2164	2169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017471	A	6	6	2194	2199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017471	CTA	2	6	2233	2238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017471	ATT	2	6	2248	2253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017471	TG	3	6	2267	2272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017471	CAT	2	6	2316	2321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017471	A	7	7	2334	2340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017471	ATT	2	6	2398	2403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017471	AT	3	6	2453	2458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017471	AG	3	6	2467	2472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017471	AAG	2	6	2475	2480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017471	A	6	6	2493	2498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017471	ATT	2	6	2534	2539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017471	T	7	7	2581	2587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017471	T	6	6	2609	2614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017471	TCA	2	6	2808	2813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017471	ATCTG	2	10	2833	2842	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017471	A	6	6	3090	3095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017471	A	6	6	3124	3129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017471	ATG	2	6	3573	3578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017471	T	6	6	3990	3995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017471	AT	3	6	4025	4030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017471	AAT	2	6	4088	4093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017471	AATT	2	8	4100	4107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017471	A	7	7	4158	4164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017471	AGAA	2	8	4172	4179	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017471	ATGA	2	8	4190	4197	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017471	TCAA	2	8	4227	4234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017471	AGCA	2	8	4269	4276	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017471	ACTG	2	8	4300	4307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017471	GCTG	2	8	4337	4344	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017471	TCA	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017471	AGC	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017471	ACC	2	6	4526	4531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.